<?xml version="1.0" encoding="utf-8" standalone="yes"?><rss version="2.0" xmlns:atom="http://www.w3.org/2005/Atom"><channel><title>Neuroimaging |</title><link>https://chaeniverse.github.io/tags/neuroimaging/</link><atom:link href="https://chaeniverse.github.io/tags/neuroimaging/index.xml" rel="self" type="application/rss+xml"/><description>Neuroimaging</description><generator>HugoBlox Kit (https://hugoblox.com)</generator><language>en-us</language><lastBuildDate>Fri, 01 May 2026 00:00:00 +0000</lastBuildDate><image><url>https://chaeniverse.github.io/media/icon_hu_da05098ef60dc2e7.png</url><title>Neuroimaging</title><link>https://chaeniverse.github.io/tags/neuroimaging/</link></image><item><title>Future DaTScan Synthesis for Parkinson's Progression with Conditional Wavelet Diffusion</title><link>https://chaeniverse.github.io/projects/ppmi-cwdm-progression/</link><pubDate>Fri, 01 May 2026 00:00:00 +0000</pubDate><guid>https://chaeniverse.github.io/projects/ppmi-cwdm-progression/</guid><description>&lt;h4 id="개요"&gt;개요&lt;/h4&gt;
&lt;p&gt;파킨슨병(Parkinson&amp;rsquo;s disease, PD) 환자의 도파민 신경 퇴행 진행을 예측하기 위한 딥러닝 프레임워크입니다. 초기(screening) DaTScan SPECT 영상 한 장을 조건으로 2년 후(V04) 시점의 DaTScan 영상을 합성해, 반복 촬영 없이 개인 수준의 진행 양상을 시각적으로 예측합니다.&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;기존 연구는 미래 UPDRS 점수 등 &lt;strong&gt;수치 예측&lt;/strong&gt;에 그쳤지만, 본 연구는 &lt;strong&gt;영상 자체를 생성&lt;/strong&gt;해 도파민 손실의 공간적 분포를 정성적으로도 보여줍니다. 임상에서 의사가 영상을 직접 판독해 진단하는 현실을 고려하면 정량 + 정성 모두 의미가 있습니다.&lt;/p&gt;
&lt;h4 id="배경"&gt;배경&lt;/h4&gt;
&lt;p&gt;DaTScan은 파킨슨병 진단의 핵심 영상 바이오마커지만, 방사선 피폭, 추적자 주입 후 3–6시간 대기, 핵의학 장비 접근성, 운동 증상이 진행된 환자의 SPECT 자세 유지 어려움 등으로 종단적(longitudinal) 추적 촬영에 실질적 제약이 따릅니다. 초기 영상만으로 미래 시점의 도파민 분포 패턴을 예측할 수 있다면, 불필요한 반복 촬영 없이 개인화된 예후 예측과 조기 예방적 권고가 가능해집니다.&lt;/p&gt;
&lt;h4 id="데이터"&gt;데이터&lt;/h4&gt;
&lt;ul&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;출처&lt;/strong&gt;: Parkinson&amp;rsquo;s Progression Markers Initiative (PPMI)&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;구성&lt;/strong&gt;: 스크리닝(SC) 시점과 2년 후(V04) 시점의 DaTScan SPECT 영상 쌍, 품질 관리 후 &lt;strong&gt;746쌍&lt;/strong&gt;&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;전처리&lt;/strong&gt;: 공간 정규화 + 강도 정규화&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;분할&lt;/strong&gt;: train / validation / test = 7 : 1.5 : 1.5&lt;/li&gt;
&lt;/ul&gt;
&lt;h4 id="방법론"&gt;방법론&lt;/h4&gt;
&lt;p&gt;&lt;strong&gt;조건부 웨이블릿 확산 모델 (cWDM).&lt;/strong&gt; Friedrich et al. (2024)의 cWDM 프레임워크를 적용했습니다. 학습 기반 오토인코더와 달리 웨이블릿 변환은 &lt;strong&gt;정보 손실 없이&lt;/strong&gt; 영상을 저주파(전체 구조)와 고주파(세밀한 디테일) 성분으로 분해하고, 역변환으로 완벽 복원합니다.&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;&lt;strong&gt;3D Haar Wavelet.&lt;/strong&gt; 128³ 복셀 영상을 64³ × 8채널의 웨이블릿 계수로 분해해 모든 정보를 보존하면서 연산량을 크게 줄였습니다.&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;&lt;strong&gt;손실 함수.&lt;/strong&gt; 표준 DDPM noise prediction loss:&lt;/p&gt;
$$\mathcal{L} = \mathbb{E}_{t, \mathbf{x}_0, \boldsymbol{\epsilon}} \big[\, \|\boldsymbol{\epsilon} - \boldsymbol{\epsilon}_\theta(\mathbf{x}_t, t, \mathbf{c})\|^2 \,\big]$$&lt;p&gt;조건 변수 &lt;strong&gt;c&lt;/strong&gt; 는 baseline (SC 시점) DaTScan 영상입니다.&lt;/p&gt;
&lt;h4 id="평가-지표"&gt;평가 지표&lt;/h4&gt;
&lt;ul&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;영상 품질&lt;/strong&gt;: PSNR, SSIM, RMSE&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;임상적 유효성&lt;/strong&gt;: Striatal Binding Ratio (SBR) — 미상핵(caudate), 피각(putamen), 피각/미상핵 비율(P/C ratio)&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;정성 평가&lt;/strong&gt;: 임상용 color lookup table을 적용해 baseline · 실제 V04 · 합성 V04 비교&lt;/li&gt;
&lt;/ul&gt;
&lt;h4 id="결과"&gt;결과&lt;/h4&gt;
&lt;p&gt;테스트 세트(n = 112)에서 합성된 V04 영상의 정량 성능:&lt;/p&gt;
&lt;ul&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;PSNR&lt;/strong&gt;: 21.99 ± 2.40 dB&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;SSIM&lt;/strong&gt;: 0.6452 ± 0.065&lt;/li&gt;
&lt;/ul&gt;
&lt;p&gt;부위별 SBR은 실제 추적 영상과 강한 상관을 보였습니다:&lt;/p&gt;
&lt;ul&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;전체 선조체(striatum)&lt;/strong&gt;: r = 0.676, p &amp;lt; 0.001&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;미상핵(caudate)&lt;/strong&gt;: r = 0.699, p &amp;lt; 0.001&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;피각(putamen)&lt;/strong&gt;: r = 0.660, p &amp;lt; 0.001&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;피각/미상핵 비율 (P/C ratio)&lt;/strong&gt;: r = 0.670, p &amp;lt; 0.001&lt;/li&gt;
&lt;/ul&gt;
&lt;p&gt;임상용 color scale을 적용한 정성적 비교에서, 합성 영상은 선조체 영역의 전반적 섭취 위치를 반영하였으나 세부 구조의 선명도에는 한계가 있었습니다.&lt;/p&gt;
&lt;h4 id="결론"&gt;결론&lt;/h4&gt;
&lt;p&gt;단일 초기 DaTScan 영상으로부터 2년 후 영상을 합성하는 딥러닝 프레임워크를 제시했고, 피각/미상핵 비율을 포함한 부위별 진행 지표에서 실제 추적 영상과 유의한 상관관계를 확인했습니다. 향후 임상 변수와의 결합을 통해 개인화된 파킨슨병 진행 예측 모델로 확장될 수 있습니다.&lt;/p&gt;
&lt;h4 id="성과"&gt;성과&lt;/h4&gt;
&lt;p&gt;이채현, 이기림, 정봉기, 최수인, 박보용, &amp;ldquo;딥러닝 기반 파킨슨병 도파민 수송체 영상의 종단적 진행 예측: 조건부 웨이블릿 확산 모델을 활용한 미래 DaTScan 영상 합성&amp;rdquo;, &lt;em&gt;한국통계학회&lt;/em&gt;, 2026 (포스터, 1저자).&lt;/p&gt;</description></item><item><title>Cross-Modality Neonatal Brain Image Conversion with Latent Diffusion</title><link>https://chaeniverse.github.io/projects/neonatal-brain-diffusion/</link><pubDate>Mon, 01 Sep 2025 00:00:00 +0000</pubDate><guid>https://chaeniverse.github.io/projects/neonatal-brain-diffusion/</guid><description>&lt;h4 id="개요"&gt;개요&lt;/h4&gt;
&lt;p&gt;신생아 뇌 MRI에서 routinely 수집되는 T2-weighted (T2w) 영상으로부터 T1-weighted (T1w) 영상을 합성하는 cross-modality conversion 모델을 개발했습니다. T1w와 T2w는 조직 특성을 상보적으로 표현하지만, 신생아의 경우 짧은 스캔 시간, 움직임 인공물, 진정제 사용 위험 등으로 두 contrast 모두를 얻기 어렵습니다. 본 연구는 누락된 modality를 합성해 multi-contrast 진단을 가능케 하는 빠르고 sedation-free한 경로를 제시합니다.&lt;/p&gt;
&lt;h4 id="방법론"&gt;방법론&lt;/h4&gt;
&lt;p&gt;&lt;strong&gt;모델 구조.&lt;/strong&gt; 2D slice-wise conditional latent diffusion model (LDM)을 설계했습니다. 40쌍의 bias field-corrected T1w/T2w 데이터를 z-축 기준으로 slicing하고, Autoencoder-KL로 latent 공간에 인코딩한 뒤, T2w latent와 modality 조건 정보를 spatially aligned 방식으로 결합해 conditional image-to-image translation을 수행했습니다.&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;&lt;strong&gt;선행 기법과의 비교.&lt;/strong&gt; 기존 GAN 기반 cross-modality translation은 학습 과정의 특성상 mode collapse, 비수렴, 불안정성 문제가 빈번했습니다. Denoising Diffusion Probabilistic Model (DDPM) 계열은 noise-perturbation 학습 과정 덕분에 더 안정적이고 다양한 출력을 생성하며, 영상 합성 task에서 GAN보다 우수함이 보고되었습니다.&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;&lt;strong&gt;손실 함수.&lt;/strong&gt; Latent space와 conditioning key $\mathbf{y}$, diffusion time step $t$ 를 함께 고려한 LDM의 noise prediction loss는 다음과 같이 정의됩니다.&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;
&lt;figure &gt;
&lt;div class="flex justify-center "&gt;
&lt;div class="w-full" &gt;
&lt;img alt="LDM noise prediction loss"
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&lt;/div&gt;&lt;/figure&gt;
&lt;/p&gt;
&lt;h4 id="결과"&gt;결과&lt;/h4&gt;
&lt;p&gt;Held-out test set에서 합성 T1w 영상이 다음 성능을 달성했습니다.&lt;/p&gt;
&lt;ul&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;PSNR&lt;/strong&gt;: 21.03 dB&lt;/li&gt;
&lt;li&gt;&lt;strong&gt;SSIM&lt;/strong&gt;: 0.6963&lt;/li&gt;
&lt;/ul&gt;
&lt;h4 id="의의"&gt;의의&lt;/h4&gt;
&lt;p&gt;T2w만으로 누락된 T1w를 생성할 수 있어 multi-contrast neonatal MRI에 빠르고 sedation-free한 접근 경로를 제공합니다. 본 framework는 infant 또는 fetal MRI 데이터로도 자연스럽게 확장 가능합니다.&lt;/p&gt;
&lt;h4 id="성과"&gt;성과&lt;/h4&gt;
&lt;blockquote class="border-l-4 border-neutral-300 dark:border-neutral-600 pl-4 italic text-neutral-600 dark:text-neutral-400 my-6"&gt;
&lt;p&gt;C.H. Lee, K. Lee, B. Park, &amp;ldquo;Cross-Modality Neonatal Brain Image Conversion Using a Latent Diffusion Model,&amp;rdquo; &lt;em&gt;2025 Second International Conference on Artificial Intelligence for Medicine, Health and Care (AIxMHC)&lt;/em&gt;, IEEE, 2025. (Oral)&lt;/p&gt;
&lt;/blockquote&gt;</description></item><item><title>Whole-Brain Functional Gradients in Migraine</title><link>https://chaeniverse.github.io/projects/migraine-functional-gradients/</link><pubDate>Sat, 01 Apr 2023 00:00:00 +0000</pubDate><guid>https://chaeniverse.github.io/projects/migraine-functional-gradients/</guid><description>&lt;h4 id="개요"&gt;개요&lt;/h4&gt;
&lt;p&gt;R과 Python을 활용해 편두통 환자군 데이터 분석을 수행하였습니다. 편두통 환자의 뇌 기능 저하를 정량적으로 평가하기 위한 모델을 구축하고 &lt;em&gt;Human Brain Mapping&lt;/em&gt;에 1저자로 출판했습니다.&lt;/p&gt;
&lt;h4 id="방법론"&gt;방법론&lt;/h4&gt;
&lt;p&gt;&lt;strong&gt;차원 축소.&lt;/strong&gt; 고차원의 뇌 영상 데이터를 비선형 매니폴드 러닝 기법으로 저차원으로 축소시켜 저차원 고유벡터를 생성했습니다. 결과에 영향을 미칠 수 있는 성별, 나이 등의 요소를 보정하여 다변량 분석을 수행했습니다.&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;&lt;strong&gt;집단 간 비교.&lt;/strong&gt; 올바른 통계적 유의성 검정을 위해 false discovery rate (FDR) 보정을 거쳐 환자군과 정상군 사이에 영상 특징 데이터가 유의한 차이를 보이는 뇌 영역을 검출했습니다.&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;피질뿐만 아니라 피질-피질하 (subcortico-cortical) 연결성으로 가중된 매니폴드까지 확장해 피질하 영역에서도 환자군 특이적 차이를 검출했습니다.&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;
&lt;figure &gt;
&lt;div class="flex justify-center "&gt;
&lt;div class="w-full" &gt;
&lt;img alt="Subcortical-weighted manifolds and between-group differences"
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&lt;/div&gt;&lt;/figure&gt;
&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;&lt;strong&gt;예측 모델링.&lt;/strong&gt; 편두통의 발병 횟수라는 임상학적 지표를 예측하기 위해 머신러닝 기법을 도입했습니다. 구체적으로, least absolute shrinkage and selection operator (LASSO)를 적용해 영상 피처들을 추출하고, 5-겹 중첩 교차 검증을 갖는 선형 회귀식으로 예측 모형을 구축했습니다. 내부 훈련 데이터 세트에서 성별과 나이를 보정한 후, intra class correlation (ICC)와 mean absolute error (MAE)를 기준으로 모델을 선출하고, 최종적으로 외부 검정 데이터 세트의 임상적 변수들을 예측했습니다. 피실험자들을 뽑는 과정에서 편향이 생기지 않도록 이 과정을 100회 반복했습니다. 예측 정확도는 실제 값과 예측 값 사이의 스피어만 상관 계수, ICC, MAE를 계산해 평가했고, 상관계수의 유의성은 비모수 순열 검정을 기반으로 결정했습니다.&lt;/p&gt;
&lt;p&gt;
&lt;figure &gt;
&lt;div class="flex justify-center "&gt;
&lt;div class="w-full" &gt;
&lt;img alt="Selected feature probability and prediction performance for headache frequency"
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&lt;/div&gt;&lt;/figure&gt;
&lt;/p&gt;
&lt;h4 id="성과"&gt;성과&lt;/h4&gt;
&lt;p&gt;본 연구를 통해 주어진 데이터를 명확하게 이해하고, 해당 데이터를 분석하기 위해 올바르고 견고한 통계 분석 기법을 적용하는 방법을 익혔습니다. 결과는 다음과 같이 출판되었습니다.&lt;/p&gt;
&lt;blockquote class="border-l-4 border-neutral-300 dark:border-neutral-600 pl-4 italic text-neutral-600 dark:text-neutral-400 my-6"&gt;
&lt;p&gt;C.H. Lee, H. Park, M.J. Lee, B. Park, &amp;ldquo;Whole-Brain Functional Gradients Reveal Cortical and Subcortical Alterations in Patients with Episodic Migraine,&amp;rdquo; &lt;em&gt;Human Brain Mapping&lt;/em&gt;, Apr. 2023.&lt;/p&gt;
&lt;/blockquote&gt;</description></item></channel></rss>